H Διαχειριστική αρχή του Ε.Π. «Τεχνική Υποστήριξη Εφαρμογής» ασκεί τις αντίστοιχες αρμοδιότητες Διαχειριστικής Αρχής Επιχειρησιακού προγράμματος, όπως περιγράφονται στο άρθρο 60 του Καμ. (ΕΚ) 1083/06 και εξειδικεύονται στο κεφάλαιο των διατάξεων εφαρμογής του Ε.Π. Τ.Υ.Ε.